El vector basó la herramienta de diseño del siRNA

Las herramientas incluyen:

* buscador de la blanco del siRNA: Una herramienta del software para
identificar secuencia única de la blanco del siRNA del candidato en
su secuencia de la DNA.
* constructor de la construcción del siRNA: Una herramienta del
software para construir el relleno pequeño de la horquilla de la
blanco del siRNA para el vector de la expresión.
* desmodulador de la secuencia del siRNA: Una herramienta del software
para crear una secuencia revuelta como control negativo para su
experimento del siRNA.

Referencia:

Bioinformatics. 2004 julio 22;20(11): 1818-20. Un centro de
concepción de Web-based para el siRNA y el cassette
vector-basados del siRNA. Wang L, Mu FY.

RESUMEN: Para facilitar el proceso que diseñaba para el siRNA y el
cassette vector-basados del siRNA, un sistema de herramienta se ha
desarrollado que consistía en un buscador de la blanco del siRNA, un
constructor de la construcción del siRNA y un desmodulador de la
secuencia del siRNA. El buscador de la blanco del siRNA se utiliza
para identificar sitios de la blanco del siRNA del candidato. El
programa automatiza la homología que se filtra, reduce al mínimo la
reacción cruzada no específica, sitios de la blanco de los filtros
basados en estabilidad interna del duplex del RNA y la estructura
secundaria del filamento del siRNA sense/anti-sense. El constructor de
la construcción del siRNA se utiliza para crear una construcción de
la horquilla del siRNA como un relleno del vector o relleno del
cassette. El desmodulador de la secuencia del siRNA se utiliza para
generar una secuencia de control negativa para los experimentos del
siRNA. Junto, estos programas proporcionan un sistema comprensivo de
la utilidad para tratar la necesidad específica del bioinformatics
del diseño DNA-BASADO del siRNA. DISPONIBILIDAD: Las herramientas de
diseño de Web-based están disponibles en el Web site de
GenScript (centro de concepción del siRNA). http://www.genscript.com
o http://www.genscript.com/rnai.html#design o
http://www.genscript.com/sirna_ca.html#design

28-Aug-2006, Rating n/a of 1 votes.