biowww.net
Search biowww:

Biowww / Moleculaire Biologie / Het gen van RNAi siRNA het tot zwijgen brengen / siRNA ontwerp


Vector gebaseerd siRNA ontwerphulpmiddel


Vector gebaseerd siRNA ontwerphulpmiddel

De hulpmiddelen omvatten:

* de Vinder van het Doel siRNA: Een softwarehulpmiddel om unieke
kandidaatsiRNA doelopeenvolging in uw opeenvolging te identificeren
DNA.
* de Bouwer van het Concept siRNA: Een softwarehulpmiddel om klein
haarspeldtussenvoegsel van doel siRNA voor uitdrukkingsvector te
bouwen.
* de Vervormer van de Opeenvolging siRNA: Een softwarehulpmiddel om
een scrambled opeenvolging als negatieve controle voor uw experiment
tot stand te brengen siRNA.

Verwijzing:

Bio-informatica. 2004 Juli 22;20 (11): 1818-20. een Web-based
ontwerpcentrum voor vector-gebaseerde cassette siRNA en siRNA.
Wang L, Mu FY.

SAMENVATTING: Om het het ontwerpen proces voor vector-gebaseerde
cassette te vergemakkelijken siRNA en siRNA, is een hulpmiddelreeks
ontwikkeld bestaand uit een siRNA doelvinder, een siRNA conceptbouwer
en een siRNA opeenvolgingsvervormer. De siRNA doelvinder wordt
gebruikt om kandidaatsiRNA doelplaatsen te identificeren. Het
programma automatiseert homologie het filtreren, minimaliseert
niet-specifieke cross-reaction, de plaatsen van het filtersdoel die op
de duplex interne stabiliteit van RNA en betekenis siRNA/anti-sense
bundel secundaire structuur worden gebaseerd. De siRNA conceptbouwer
wordt gebruikt om een siRNA haarspeldconcept als vectortussenvoegsel
of cassettetussenvoegsel tot stand te brengen. De siRNA
opeenvolgingsvervormer wordt gebruikt om een negatieve
controleopeenvolging voor experimenten te produceren siRNA. Samen,
verstrekken deze programma's een uitvoerig nut dat wordt geplaatst om
op de specifieke bio-informaticabehoefte aan op DNA-Gebaseerd ontwerp
gericht te zijn siRNA. BESCHIKBAARHEID: De Web-based
ontwerphulpmiddelen zijn beschikbaar bij GenScript- Website
(ontwerpcentrum siRNA). http://www.genscript.com of
http://www.genscript.com/rnai.html#design of
http://www.genscript.com/sirna_ca.html#design

28-Aug-2006, Rating n/a of 1 votes.

Schrijf uw commentaar


Uw naam
Uw e-mail
Uw commentaar
Uw classificatie
Verwant middel
Het Webhulpmiddel van Sfold: siRNA, antisense, trans-splijt ribozymes ontwerphulpmiddel


siRNA ontwerphulpmiddel dat SVM gebruikt


shRNA het hulpmiddel van het oligosontwerp voor shRNA gebaseerde uitdrukkingsvector


Het ontwerp en de exogene levering van siRNA voor hettranscriptional gen tot zwijgen brengen


siRNA selecteurshulpmiddel van wistar instituut